Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4931417E11RikQ9CR05 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
4931417E11RikQ9CR05 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms