Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PsenenQ9CQR7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PsenenQ9CQR7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PsenenQ9CQR7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PsenenQ9CQR7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms