Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR6

Ppp6c, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6cQ9CQR6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp6cQ9CQR6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp6cQ9CQR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp6cQ9CQR6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp6cQ9CQR6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp6cQ9CQR6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms