Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTRAFQ9CQE8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms