Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap3bQ9CQE1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap3bQ9CQE1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms