Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl39lQ9CQD0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms