Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC7

Ndufb4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb4Q9CQC7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufb4Q9CQC7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb4Q9CQC7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms