Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nudcd2Q9CQ48 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nudcd2Q9CQ48 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms