Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mid1ip1Q9CQ20 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms