Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl17Q9CPR4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl17Q9CPR4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl17Q9CPR4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl17Q9CPR4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms