Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tomm22Q9CPQ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tomm22Q9CPQ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tomm22Q9CPQ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tomm22Q9CPQ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms