Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2a1Q99PM3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2a1Q99PM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms