Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcg5Q99PE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Abcg5Q99PE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcg5Q99PE8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms