Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms