Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atoh8Q99NA2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atoh8Q99NA2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms