Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cadm3Q99N28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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