Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6cQ99N08 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a6cQ99N08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms