Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SrrtQ99MR6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrrtQ99MR6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms