Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtprtQ99M80 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprtQ99M80 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprtQ99M80 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1237.8 ms