Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cstf3Q99LI7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cstf3Q99LI7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms