Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds2Q99L43 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds2Q99L43 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cds2Q99L43 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cds2Q99L43 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms