Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pagr1aQ99L02 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms