Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmp1Q99KU0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmp1Q99KU0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms