Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms