Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lactb2Q99KR3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lactb2Q99KR3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms