Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf19Q99KP6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms