Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab28Q99KL7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab28Q99KL7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms