Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK9

Hars2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hars2Q99KK9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hars2Q99KK9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hars2Q99KK9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms