Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf19Q99KJ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf19Q99KJ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms