Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms