Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn3Q99JH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn3Q99JH7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn3Q99JH7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms