Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Def8Q99J78 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms