Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec3Q99J72 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec3Q99J72 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms