Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctu1Q99J10 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctu1Q99J10 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctu1Q99J10 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms