Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trps1Q925H1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trps1Q925H1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trps1Q925H1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trps1Q925H1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trps1Q925H1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms