Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csmd1Q923L3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csmd1Q923L3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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