Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b5Q923D4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms