Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Clip1Q922J3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Clip1Q922J3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Clip1Q922J3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 400 ms