Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf7Q922B6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Traf7Q922B6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Traf7Q922B6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf7Q922B6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms