Protein–RNA interactions for Protein: Q921X6

Polr3f, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3fQ921X6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr3fQ921X6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr3fQ921X6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3fQ921X6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms