Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin3bQ91ZU9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin3bQ91ZU9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms