Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx18Q91ZR2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx18Q91ZR2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx18Q91ZR2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms