Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab4bQ91ZR1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab4bQ91ZR1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab4bQ91ZR1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms