Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc5a4bQ91ZP4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc5a4bQ91ZP4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slc5a4bQ91ZP4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc5a4bQ91ZP4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms