Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lims2Q91XD2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lims2Q91XD2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lims2Q91XD2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms