Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd3Q91WC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setd3Q91WC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Setd3Q91WC0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms