Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csde1Q91W50 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csde1Q91W50 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Csde1Q91W50 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms