Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bgrl3Q91VW3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms