Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Farp2Q91VS8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Farp2Q91VS8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Farp2Q91VS8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Farp2Q91VS8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Farp2Q91VS8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Farp2Q91VS8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Farp2Q91VS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Farp2Q91VS8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Farp2Q91VS8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Farp2Q91VS8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Farp2Q91VS8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms