Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ5

Pqbp1, Polyglutamine-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqbp1Q91VJ5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pqbp1Q91VJ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pqbp1Q91VJ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pqbp1Q91VJ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pqbp1Q91VJ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pqbp1Q91VJ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pqbp1Q91VJ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pqbp1Q91VJ5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms